本学初代学長新渡戸稲造博士の蔵書を納めています。博士の蔵書のうち、没後ご遺族より寄贈を受けた約3,300冊（北海道大学等へ寄贈された農政学、農業経済学、植民地問題等以外）を中心に、学長時代、学生利用の図書館蔵書用に本学へ寄贈されたものが加えられた、合計約5,700冊の洋書からなります。キリスト教・歴史・伝記・文学など広い分野にわたり、特に伝記ではジャンヌ・ダルク、リンカーン関係の蒐集が注目されています。

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1998年9月に丸山家から東京女子大学に、丸山眞男氏が遺された膨大な図書資料類や各種草稿資料類が寄贈され、1999年春から図書館の丸山眞男文庫室に収蔵されています。
東京女子大学では、丸山眞男記念比較思想研究センターを設置して、丸山文庫の整理を進め、順次公開しています。詳細は、以下のページを参照してください。

「丸山眞男記念比較思想研究センター」についてはこちらをご覧ください。

丸山眞男文庫の公開についてはこちらをご覧ください。